TAP Trihelix in Setaria italica

Full lineage¹: cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; Mesangiospermae; Liliopsida; Petrosaviidae; commelinids; Poales; Poaceae; PACMAD clade; Panicoideae; Panicodae; Paniceae; Cenchrinae; Setaria

Protein source: Phytozome v11


The colour code corresponds to the rules for the domains:

should be contained
should not be contained

Domain rules

trihelix

(Domain names are clickable)



List of proteins (29)

hide all | show all
namename additionClick button to show/hide sequence: Download sequence?
Seita.1G003700.1.ppacid=32696138 transcript=Seita.1G003700.1 locus=Seita.1G003700 ID=Seita.1G003700.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.1G163600.1.ppacid=32696748 transcript=Seita.1G163600.1 locus=Seita.1G163600 ID=Seita.1G163600.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.1G185600.1.ppacid=32696995 transcript=Seita.1G185600.1 locus=Seita.1G185600 ID=Seita.1G185600.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.1G186900.1.ppacid=32695489 transcript=Seita.1G186900.1 locus=Seita.1G186900 ID=Seita.1G186900.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.1G201000.1.ppacid=32694378 transcript=Seita.1G201000.1 locus=Seita.1G201000 ID=Seita.1G201000.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.1G253600.1.ppacid=32694717 transcript=Seita.1G253600.1 locus=Seita.1G253600 ID=Seita.1G253600.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.2G014000.1.ppacid=32720603 transcript=Seita.2G014000.1 locus=Seita.2G014000 ID=Seita.2G014000.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.2G079000.1.ppacid=32721331 transcript=Seita.2G079000.1 locus=Seita.2G079000 ID=Seita.2G079000.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.2G305400.1.ppacid=32722088 transcript=Seita.2G305400.1 locus=Seita.2G305400 ID=Seita.2G305400.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.3G049300.1.ppacid=32710624 transcript=Seita.3G049300.1 locus=Seita.3G049300 ID=Seita.3G049300.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.3G148300.1.ppacid=32714200 transcript=Seita.3G148300.1 locus=Seita.3G148300 ID=Seita.3G148300.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.5G267100.1.ppacid=32684148 transcript=Seita.5G267100.1 locus=Seita.5G267100 ID=Seita.5G267100.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.5G298100.1.ppacid=32686510 transcript=Seita.5G298100.1 locus=Seita.5G298100 ID=Seita.5G298100.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.6G188700.1.ppacid=32701514 transcript=Seita.6G188700.1 locus=Seita.6G188700 ID=Seita.6G188700.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G079900.1.ppacid=32705373 transcript=Seita.7G079900.1 locus=Seita.7G079900 ID=Seita.7G079900.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G087200.1.ppacid=32702926 transcript=Seita.7G087200.1 locus=Seita.7G087200 ID=Seita.7G087200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G112500.1.ppacid=32704175 transcript=Seita.7G112500.1 locus=Seita.7G112500 ID=Seita.7G112500.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G144200.1.ppacid=32705093 transcript=Seita.7G144200.1 locus=Seita.7G144200 ID=Seita.7G144200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G184300.1.ppacid=32705088 transcript=Seita.7G184300.1 locus=Seita.7G184300 ID=Seita.7G184300.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G184400.1.ppacid=32703421 transcript=Seita.7G184400.1 locus=Seita.7G184400 ID=Seita.7G184400.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G185800.1.ppacid=32704994 transcript=Seita.7G185800.1 locus=Seita.7G185800 ID=Seita.7G185800.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G225800.1.ppacid=32705634 transcript=Seita.7G225800.1 locus=Seita.7G225800 ID=Seita.7G225800.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G146700.1.ppacid=32689867 transcript=Seita.9G146700.1 locus=Seita.9G146700 ID=Seita.9G146700.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G192000.1.ppacid=32693476 transcript=Seita.9G192000.1 locus=Seita.9G192000 ID=Seita.9G192000.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G318500.1.ppacid=32687476 transcript=Seita.9G318500.1 locus=Seita.9G318500 ID=Seita.9G318500.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G439400.1.ppacid=32690383 transcript=Seita.9G439400.1 locus=Seita.9G439400 ID=Seita.9G439400.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G439500.1.ppacid=32690310 transcript=Seita.9G439500.1 locus=Seita.9G439500 ID=Seita.9G439500.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G463800.1.ppacid=32692956 transcript=Seita.9G463800.1 locus=Seita.9G463800 ID=Seita.9G463800.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G570100.1.ppacid=32693229 transcript=Seita.9G570100.1 locus=Seita.9G570100 ID=Seita.9G570100.1.v2.2 annot-version=v2.2
select all | unselect

A list of species letter codes included in the protein names can be found here (opens in new tab).

↑ back to top


¹ Information recieved using NCBI E-utilities and NCBI taxonomy database.
Impressum